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党政管理机构  
党政办公室 组织部(党校、巡察工作办公室) 宣传部 统战部(台港澳事务办公室)
纪委(监察专员办公室)机关 人事处(人才工作办公室、教师工作部) 教务处 学生工作处(武装部)
研究生处 科技处 发展规划与学科建设处 社会合作处
财务处 审计处 资产管理处 网络信息管理处
国际合作交流处 保卫处 后勤保障处 离退休工作处
莱阳校区管理办公室 平度校区管理办公室 蓝谷校区管理办公室 工会(妇委会)
团委      
教学机构
农学院 植物医学学院 资源与环境学院
园艺学院 动物科技学院 草业学院
动物医学院 机电工程学院 建筑工程学院
生命科学学院 食品科学与工程学院 经济管理学院(合作社学院)
人文社会科学学院 化学与药学院 艺术学院
外国语学院 动漫与传媒学院 理学与信息科学学院(软件服务外包学院)
海洋科学与工程学院 园林与林学院 国际教育学院
巴瑟斯未来农业科技学院 马克思主义学院 创新创业学院
继续教育学院 体育教学部  
科研机构
新农村发展研究院(乡村振兴研究院) 特种食品研究院
黄河三角洲盐碱地农业研究院 智慧农业研究院
农业传播与教育研究院(齐民书院)
教辅机构
图书馆 档案馆
实验室管理中心 现代农业科技服务中心
学报编辑部  
其他机构
党政办公室 政策研究室、法律事务办公室
宣传部 新闻中心
科技处 服务青岛办公室、服务地方办公室、蓝黄办公室
社会合作处 校友工作办公室教育发展基金会办公室
实验室管理中心 中心实验室
新农村发展研究院 实施乡村振兴工作领导小组办公室、青岛市乡村振兴研究院
研究机构
中国农村发展研究院 山东省旱作农业技术重点实验室 山东省应用真菌重点实验室
山东省高校植物生物技术重点实验室 国家牧草产业技术体系青岛综合试验站 农用生物药创制技术国家地方联合工程实验室
国际合作经济发展研究中心 青岛市现代农业质量与安全工程重点实验室 动物基因工程与种质创新研究所
生殖科学研究院